消化系统休息：辟谷初期，由于减少了食物的摄入，消化系统得到了休息的机会。这有助于减轻消化道的工作负担，让身体有机会修复受损组织。

能量代谢调整：随着辟谷时间延长，人体开始从主要依赖碳水化合物供能转向利用脂肪储备作为主要能源。这一阶段被称为酮症状态，其中肝脏将脂肪酸转化为酮体，为大脑和其他重要器官提供能量。此过程中，身体还会加速分解并清除积累的脂肪细胞内的毒素。

脂肪分解与排毒：到了辟谷第五天左右，身体进入一个更加显著的脂肪分解阶段。除了消耗体内多余的脂肪外，伴随而来的还有通过尿液、汗液以及肠道等方式排出体内累积的废物和毒素。特别是肠道内长期积存的宿便（黑色、茶褐色等）可能会被逐渐排出，这是身体进行内部“大扫除”的迹象之一。

器官功能优化：辟谷期间，尤其是肝脏和肾脏这样的关键排毒器官，在没有额外食物来源干扰的情况下，能够更高效地执行其解毒任务。例如，肝脏可以更好地转化有害物质使之易于排泄；同时，肾脏也会增强对尿素、肌酐等代谢产物的过滤能力，帮助清理血液中的杂质。

体重下降：伴随着上述过程的发生，大多数人会观察到体重有所减轻。这是因为不仅水分被大量排出体外，而且体内储存的能量形式——脂肪也被持续消耗掉了。